学术交流美国宾夕法尼亚大学LiHong

3月22日,著名生物统计学家,美国宾夕法尼亚大学LiHongzhe教授到访上海交大-耶鲁大学生物统计学联合中心,并做了学术报告。题目是《MethodsforHighDimensionalCompositionalDataAnalysisinMicrobiomeStudies》。

首先,上海交通大学生物信息学与生物统计学系王涛老师做了开场介绍,热忱欢迎Li教授的到来。王老师介绍到,Li教授是宾夕法尼亚大学生物统计学研究生项目的主席和大数据统计中心的主任。同时担任美国统计协会(ASA)、数理统计学会(IMS)、美国科学促进会(AAAS)当选会员,以及美国国家癌症研究所科学顾问委员会委员。

Li教授在开篇介绍了微生物组及其与人体基因组的关系,微生物组数据的来源,以及对微生物组数据的常规处理方法。Li教授提到,采样过程和测序深度均会导致微生物组数据中存在过多的零。如何有效估计物种的真实比例,是一个棘手的问题。Li教授提出了一种新的方法:惩罚降秩回归。通过利用样本或物种之间的相关性,该方法可以对比例数据进行光滑处理。

在第二个部分,Li教授提到,由于测序深度不同,不同样本观测数据之间不可比较。微生物组数据包含的是物种相对丰度信息,是成分数据。进一步地,Li教授简要分享了如何处理预测变量是成分数据的回归问题。

最后是提问环节。来自不同领域的老师和同学,针对于科研中所遇到的问题发起了提问,现场气氛活跃。Li教授不仅做了详细耐心的回答,还提出了自己独到的见解。

报告在掌声中谢幕。本次报告取得了热烈反响。

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